Nat Genet： 生物癌症中病毒分布

丹麦胃癌研究之前心 Peter Lichter 小三组除此以外研究探索了生命体胃癌之前感染的分布。上旬《共存—遗传学》在线登载了这一成果。

作为泛癌同类型基因三组分析联盟的一部分，该数据库收集了 38 个类型的 2658 例胃癌样本的同类型基因三组和一部分转录同类型基因三组测序数据，研究人员利用互信的方法，统合了 3 个分立数据库用以系统地研究潜在的感染病原体。在 382 个基因三组和 68 个转录三组数据集之前都监测到了感染存在。研究推测，已知的与相关的感染，如爱泼斯坦—巴尔感染（EBV）、脑膜炎感染（HBV）和人瘤感染（HPV）的检出率都很很低。

这项研究揭示了头颈癌之前 HPV 和驱动基因特异性的引人注意排他性以及 HPV 与 APOBEC 特异性特征的相关性，这表明抗感染防御能力下降是宫颈癌、肝癌和头颈癌的诱因。对于 HBV、HPV16、HPV18 和腹相关感染 2，感染统合与基因三组拷贝数的局部变化有关。在 TERT 启动子处的统合与真核细胞的很低解读有关，从而明显激活了该的成年期过程。催化作用逆转录感染的很低解读与肾癌病人较差的生存期有关。

零碎出处：

Zapatka， M.， Borozan， I.， Brewer， D.S. et al. The landscape of viral associations in human cancers. Nat Genet (2020). https：//doi.org/10.1038/s41588-019-0558-9.